第一代嘉善站

清宣統元年（1909年），老嘉善站隨著滬杭鐵路的開工而設站。

民國3年（1914年）滬杭甬鐵路收歸國有，老嘉善站由四等站升為三等站 。

民國9年（1920年）嘉善站站房改造，房屋擴建至20間 。

民國26年（1937年）11月，日軍進犯嘉善與中國守軍連日激戰，并對嘉善站進行轟炸掃射 。

截至1988年，老嘉善站站內房屋總面積為3500平方米，其中主要有旅客候車室170平方米、售票房109平方米、行李房110平方米，行車室和貨運辦公室159平方米 。

第二代嘉善站

剛落成時的第二代嘉善站

1992年1月5日，新嘉善站破土動工，由原址向西移動500米，位于魏塘街道亭橋北路。

1993年1月8日，嘉善站遷至新址，老站停止使用。

2004年，嘉善站候車室主站房，站前廣場進行改造裝修；站前廣場改建街心式花園廣場，增設公交站。

2006年2月11日，嘉善站新行車信號啟用 。

2019年11月，嘉善站啟動改造，以配合嘉興站的提升改造工程 。

2020年1月9日，嘉善站改造進入管道鋪設階段 。2月25日，嘉善站改造項目復工 。5月6日，嘉興站停辦客運業務，閉站進入施工階段；同日，嘉善站臨時候車廳啟用 。6月20日起，嘉善站實施電子客票 。

2021年6月25日，隨著嘉興站完成改造投入使用，嘉善站臨時候車室停止使用 。

嘉善站臨時候車室

據2015年版《嘉善縣志（1988-2008）》顯示，1993年，嘉善站候車室面積682.3平方米，可容納旅客600人左右。站場東起滬杭線91千米451米處，西至滬杭線93千米305米處，貨場設有門吊2臺 。

嘉善站為一層式建筑，站區內設有候車室、售票處。其中候車室位于站房中央，售票處和出站口分置于站房的左右兩側，站內設站務辦公室、洗手間等。候車室北面有樓梯可通向1號站臺，樓梯旁設有地道通向2、3號站臺。站前廣場設有步行區、環形道路、噴水池和綠化區、公交車站。貨場軌道設有門吊 。

據2015年版《嘉善縣志（1988-2008）》顯示，1993年，嘉善站客運場規模為2臺5線，站內設有軌道9股，由南往北為：一、二兩道為正線，三、四、六道為到發線，貨一、貨三，貨五道為貨物線，糧四道為糧食專用線，途經該站的線路為滬昆鐵路 。

截至2020年1月，嘉善站于售票大廳增設了兩臺自助售票機和兩臺取票機，讓旅客省時方便地取票 。

據2015年版《嘉善縣志（1988-2008）》顯示，1993年，嘉善站貨場擁有門吊2臺，站前廣場旁設有停車場 。

嘉善站站房

1989年，嘉善站發送旅客35.5萬人，發送貨物12.87萬噸。

1990年，嘉善站發送旅客29.6萬人，發送貨物26.9萬噸。

1995年，嘉善站發送旅客44.5萬人，發送貨物44.5萬噸。

2000年，嘉善站發送旅客51.3萬人，發送貨物51.3萬噸。

2008年，嘉善站發送旅客47.13萬人，發送貨物7.93萬噸 。

2010年，嘉善站日均發送客流650人 。

2020年國慶長假期間，嘉善站共發送旅客8.15萬人 。

嘉善站站房近觀（2019年）

2020年7月，為了讓旅客有更好的乘車體驗，嘉善站候車大廳提供了熱水及防暑應急藥物等便民服務 。

公交線路

據2020年7月嘉善公交公司官網顯示，嘉善站站前廣場設有公交車站，有五條公交線路：

注：因嘉善站場地改造，公交線路暫時遷移至火車站西約150米處的“公交服務中心”站點發車 。

滬嘉城際鐵路嘉善站總平面圖

截至2020年，滬嘉城際鐵路將在嘉善設3個車站，其中嘉善站站房面積為5566平方米，且預留遠期國鐵線下式站房，項目計劃于2020年開工，2024年投入運營 。