1956年12月19日，伴隨著鷹廈鐵路全線完工，作為起點站的廈門站正式建成。廈門站（改造前）

1957年1月6日，廈門站正式投入運營，開辦貨運業務。

1957年4月12日，廈門站正式開辦客貨運業務，為三等客貨運綜合站。當時的廈門站占地800平方米，僅有一座簡易木棚站房，候車室400平方米。

1958年運營初期，廈門站只有4股到發線（含正線和機車走行線），另有碼頭線2股，貨物線2股，調車線1股，股道長450米，站線長5.116千米，道岔20組。

20世紀50年代至60年代，由于處于兩岸對峙的特殊時期，廈門站成為重點破壞目標，多次遭到破壞。在這一時期，廈門站未進行改擴建，只延長股道長度至550米，并增加貨物線1股。重建中的廈門站北站房，2015年

1979年9月，廈門站擴建計劃得到原鐵道部批準，并于次年5月動工。

1983年5月1日，擴建完成的廈門站交付使用，新建的站房為四層建筑，包含兩個候車大廳以及售票廳、行包房及貴賓候車室。

1988年，廈門站經改造，股道增加到16股，站線總延長12.689千米。

1993年12月，廈門站實現電氣化。

1999年9月10日起，成為客運一等站。廈門站北廣場，2017年1月

2004年5月9日，廈門站由原上海鐵路局轉隸至原南昌鐵路局。

2010年4月26日，杭深線福廈段正式通車運營，廈門站成鷹廈鐵路和杭深線福廈段的終點站。

2012年4月，廈門站改擴建工程開工，包括重建站房和擴建站場，以及新建設站房和鐵路股道下5條下穿通道；同年6月29日，杭深線廈漳段開通，廈門站成為鷹廈鐵路和杭深線福廈段、廈漳段的終點站。

2014年3月1日，因廈門站改擴建工程需要，廈門站主站房封閉施工，廈門北站、廈門高崎站、漳州站分擔廈門站始發終到列車業務。

2015年2月4日，廈門站南站房、南廣場投入使用。

2015年11月10日，廈門站2、3站臺及2、3檢票口正式投入使用。新站臺投用后廈門站暫時未增開列車，而是將原有的6對南昌、福州方向動車的?？窟M行了調整。

2016年1月24日，廈門站北站房投入使用。

2019年7月10日，結合廈門北客車整備所啟用，原在廈門站始發終到的所有普速列車均調整至廈門北站始發終到。至此，廈門站成為專營動車組客運業務的車站； 12月30日起，廈門站開始推行電子客票，旅客無需取票，刷證即可乘車。

2020年6月20日，廈門火車站開行的11列普速列車正式告別紙質火車票。至此，廈門火車站全站進入“電子客票時代”。

2022年1月，開辦“鐵路e卡通”服務。

原廈門站

原廈門站站房為三層建筑，局部四層，總面積8575平方米。一樓大廳高14米，凈跨25米。站房東側為700平方米的行包房（凈跨20米），西側為700平方米的售票廳（有售票窗口9個）；二樓共設3個候車廳，中部為軟席候車區，兩翼東西各有700平方米的候車廳（各配有母嬰候車廳），可同時容納乘客1500名，設有衛生間、盥洗間、盥洗臺、飲水臺等服務設施。

廈門火車站改造效果圖

原廈門站站臺長400米，寬14.2米，合計5964平方米混凝土地面，引橋3座153平方米；地道為雙梯踏步式，梯寬3米，地道長20米，凈高2.7米，寬4米。

新廈門站

設計理念

廈門站主站房是一座外形如白鷺展翅的白色鋼結構建筑，體現了廈門海濱城市的風貌特色與時代感 。

設計參數

截至2019年11月，廈門站站房總建筑面積2.16萬平方米，高架候車室建筑面積7400平方米 。

廈門站分南北兩個站房，兩個站房的一層為進站口、售票廳、候車室和1、8檢票口，二層為候車室和2-7檢票口。南北站房的一層由鐵路股道和站臺隔開，二層的候車室是相連的。

廈門站北站房設有供旅客進站的高架橋和供旅客出站的地下層，旅客從北站房進站時，需經過高架橋才能到達進站層，而旅客從北站房出站時，無需上下樓梯，出站便是廈禾路。 南站房因地勢相比北站房較低，所以可直接由地面到達進站口。

截至2016年1月，廈門站實行動車、普速列車分口進站：持“G（高）、D（動）”字頭動車組車票的旅客，從北進站口進站（靠廈禾路）；持“K（快速火車）、Z（直達火車）、T（特快火車）”字頭列車車票的旅客，從南進站口進站（靠站南路）。

截至2019年11月，廈門站設有站臺5座（8個站臺），旅客列車到發線9條 。途經線路為鷹廈鐵路和杭深線，其中鷹廈鐵路是中國東南部地區重要的鐵路干線 ，杭深線即為中國中長期鐵路網規劃中“四縱四橫”快速客運通道的“一縱”——東南沿?？瓦\專線（杭深客運專線）。

廈門站自助售票取票設備位于廈門站南售票處和北售票處大廳內，截至2017年12月，共擁有29臺自動售票機和22臺自助取票機。 廈門站自助售票機均支持電子支付購票，電子支付的方式有銀行卡、支付寶、云閃付等，旅客可自由選擇支付方式。此外，車站仍有10臺支持現金支付的售票機，它們分別是：北廣場售票大廳編號為138、139、140的三臺自助售票機；南廣場售票大廳編號為121、122、123的三臺自助售票機；北出站口自助售取票廳編號為108、109、110、111的四臺自助售票機。

公安制證

車站售票廳設置了鐵路公安制證窗口，乘客可在窗口辦理臨時身份證明。

2017年，廈門站發送旅客1031.13萬人次。

2018年6月端午節假期，廈門站發送旅客10萬人次。

2021年4月29日至5月5日，廈門站發送旅客81.1萬人次，相比2019年同期增長1%，其中，5月1日發送旅客18.79萬人次。

“海峽情”小白鷺服務

廈門站小白鷺服務臺創建于2004年，主要提供旅客咨詢、重點旅客幫扶、遺失物品查找、廣播尋人等服務。 廈門站小白鷺服務臺

廈門站地下設有地鐵站廈門火車站，車站位于廈門站北出站口，為地下二層側式。截至2021年6月，廈門北站途經的地鐵線路有廈門地鐵1號線，共設有6個出入口，其中1、2、3、4號口位于火車站北廣場一側（1、2號口緊挨火車站北出站口），5、6號口與廈門火車站隔著廈禾路。

普通公交

廈門站周邊普通公交站點設置如下：

廈門站南廣場設有公交站“火車站南廣場站”；

廈門站北廣場東北側的廈禾路上設有公交站“火車站”；

廈禾路上鄰近廈門站北側的梧村汽車站分別在站前廣場以及地下一層設有公交站“梧村車站”和“梧村公交場站”；

廈門站北側湖濱東路廈禾路路口處設有公交站“火車站（湖東）”。

乘客可在以上公交站換乘常規公交。截至2018年9月，以上公交站共開通始發或途經的常規公交線路56條、旅游線路2條、空港快線1條。

廈門快速公交BRT在廈門站北廣場北側的廈禾路上設有火車站，截至2018年10月，廈門站快速公交車站開通快速公交線路5條。

廈門梧村汽車站設于廈門站北側的廈禾路上，2004年開始按照一級長途汽車客運站的標準建設，2009年8月1日投入使用?？偨ㄖ娣e87810平方米，采用雙層式，一層位發車位，可同時發20個班次，二層是售票大廳和候車大廳，其中售票廳共設置了14個售票窗口。

2020年11月，獲得福建省抗擊新冠肺炎疫情先進集體榮譽稱號。